青蓮院の飛地境内には「将軍塚」という直径約20m、高さ約2mにも及ぶ塚があります。青龍殿の奥殿には日本三大不動画のひとつ「青不動明王（国宝）」が安置され、また大日如来をお祀りした大日堂もあります。境内はとても広大で、四季を折々の美しさを楽しませてくれます。

奈良から長岡に都を移した桓武天皇は、様々な事故に見舞われていました。和気清麻呂は天皇をお誘いし、この山頂から京都盆地を見下ろし、ここが都の場所にふさわしいと進言されました。天皇はその勧めに従って延暦13年（794年）、平安建都に着手しました。都の鎮護のため、2.5m程の将軍の像を作り、塚に埋めるよう、天皇からの命があり、これがこの地を「将軍塚」と呼ぶ由来です。
この「将軍塚」は、国家の大事があると鳴動したという伝説が、源平盛衰記や太平記に残されています。
　
また、1338年頃には新田義貞が将軍塚付近に陣を置いて足利尊氏の軍を破ったとされています。近代では東郷元帥、黒木大将、大隈重信、菊地大雪などのお手植えの松と石柱があり、偉人達が京の都を一望して日本の将来に思いを馳せ、豊かな国造りを心に誓った由緒ある場所と言われています。

2014年に木造の大舞台が新設されました。大舞台は清水寺の舞台の４．６倍の広さがあり、京都市内はもちろん、澄み切った日には生駒山、比叡山、大阪湾まで見ることができます。
春と秋はライトアップもされるので、京都市内の夜景と幻想的なライトアップを楽しむことができます。

広大な庭園には、暖かくなると椿、桜、源平垂れ桃、藤、つつじ、しゃくなげ、さつきが咲き競います。春には桜が咲き、秋には紅葉がとても鮮やかに染まります。
青龍殿庭園は回遊式庭園に枯山水庭園を取り込んだ庭になっており、また借景庭園として東屋からの将軍塚や西山の遠望を楽しむことができます。