明治18年に創建された梨木神社は明治維新の功労者、三条実萬、実美、父子を祀り三条家の旧邸が梨木町にあったことにちなんで名付けられました。実萬公は1812年以来47年間、三代の天皇に仕え皇室の中興に尽くしたため幕府と対立し、その圧迫により一乗寺に幽居しましたが、翌年の1859年に逝去しました。実美公は明治維新後に太政大臣に任ぜられましたが、明治24年に逝去し正一位を贈られ大正4年に父を祀る梨木神社に合祀されました。

境内、手水舎の井戸　｢染井の水｣　は京の三名水の一つとして有名です。京都三名水（醒ヶ井・県井・染井）のうち、現存するのはここだけです。甘くまろやかな水は茶の湯にも適し、毎月催される月釜ではこの水で点てたお抹茶がふるまわれます。また、おみくじを染井の水に浸して、浮かびあがる文を見て占う「水みくじ」も人気です。

境内には約500株の萩が植えられており、別名萩の宮とも呼ばれています。毎年9月中旬～下旬には萩まつりが行われます。萩まつりは神事をはじめ狂言や舞踊などの奉納行事、府市民俳句大会が催され、抹茶席も連日設けられます。
　
また御神木である桂の大木は「愛の木」と呼ばれています。葉っぱの形がハート型をしているため、縁結びのご利益があると人気です。御神木そばには絵馬掛け所もあり、ハート型の「縁結び絵馬」が人気です。他には萩のモチーフが風流な「萩絵馬」もあります。