勝運・馬の神社として競馬関係者ら多数参拝されています。　
また藤森神社は、境内に二ヵ所の紫陽花苑があり、最盛期である６月には延べ1,500坪の苑内には3,500株の紫陽が咲き誇ります。その時には、たくさんの人が紫陽花を見におとづれます。
　
藤森神社は、日本書紀の編者であり、日本最初の学者である舎人親王を御祭神としてお祀りしていることから、学問の神として信仰されています。

藤森神社は、約1800年前に、神功皇后によって創建された皇室とのゆかりが深い神社です。本殿は、中御門天皇より賜ったものです。

南門から入って、まっすぐ進むと、両側に「狛犬」がおり、そこから、少し先に「拝殿」があります。そして「拝殿」のさらに先に「本殿」があり、「本殿」から右をみると、「七福神」「旗塚」「不二の水」があります。「不二の水」今まで２度涸れて３度目の神水になり地下90mから湧き出ているそうです。夏でも水を汲んだ容器が曇るぐらい冷たくておいしいです。また左を見ると、「金太郎像」「舎人親王崇敬碑」等があり、また本殿裏には、「七宮社」等があります。

本殿中央の御祭神は素盞鳴命、別雷命、日本武尊、応神天皇、仁徳天皇、神功皇后、武内宿禰の七柱。神功皇后が２０３年、新羅より凱旋後、藤森の地に、神祀りされたのが起こりです。
　
本殿東殿（東座）の御祭神は舎人親王、天武天皇の二柱。
天平宝字3（759）年、深草の里藤尾の地に鎮座。藤尾は現在の伏見稲荷の地になります。永享10（1438）年、後花園天皇の勅により、時の将軍足利義教が山頂の稲荷の祠を三麓の藤尾の地に移し、藤尾大神を藤森に遷座し、東殿に祀り、官幣の儀式が行われました。
　
本殿西殿（西座）の御祭神は早良親王、伊豫親王、井上内親王の三柱。早良親王は皇太子となられた後、蝦夷で反乱が起こったので征討将軍として当神社に詣で戦勝を祈願され、出陣しようとされたところ、これを伝え聞いた反乱軍は畏怖し、乱は戦わずして平定されました。