臨済宗大徳寺派に属し、永禄９年（１５６６）三好義嗣が義父の長慶の菩提を弔うために創建されました。聚光院の名は長慶の法名に由来したといわれています。
また千利休とその流れを汲む三千家（表千家、裏千家、武者小路千家）の菩提寺で、利休の墓を中心に茶道三千家歴代の墓所があります。
方丈（本堂）では、狩野松栄・永徳による障壁画（国宝）「花鳥図」「瀟湘八景図」ほか（国宝・複製）公開。永徳が下絵を描き、利休が作庭したと伝わる｢百積の庭｣（名勝）や茶室｢閑隠席・枡床席」（ともに重文）など様々な文化財をご覧いただけます。